En 1961, el 20% de la población de Alemania del Este había emigrado a la otra Alemania, causando pérdidas económicas a la Unión Soviética. Para evitarlo, el 13 de agosto de ese año se construyó el Muro de Berlín, con su "franja de la muerte".

Checkpoint C era el único puesto fronterizo para las Fuerzas Aliadas y extranjeros en Berlín. Para que no pareciera una frontera oficial, los aliados construyeron una pequeña caseta de madera en esta ubicación.

Poco después de la construcción del muro, los Estados Unidos y el ejército soviético tuvieron un enfrentamiento con tanques apuntándose mutuamente durante seis días. La confrontación terminó de manera pacífica cuando los soviéticos se retiraron.

Un adolescente murió desangrado cerca del punto de control después de que los guardias de Alemania Oriental le dispararan al tratar de escapar al Oeste. Ninguna de las dos partes fue en su ayuda por miedo a las consecuencias.

El muro cayó el 9 de noviembre de 1989. Aunque la reunificación no sucedió hasta un año después, Checkpoint Charlie se abrió por completo al tránsito. La caseta se retiró en octubre de 1990.